确诊案例居台湾之冠的南投县，防检部门调拨的1万剂动物用疫苗已快用光；南投县再向防检部门紧急申请1万剂支持，仅能先调拨2000剂。

最先传出狂犬病鼬獾咬人的台东县，由当局拨给犬猫狂犬病疫苗9000剂，到29日已施打5787剂，台东县动物防疫所表示，剩余疫苗只能撑2天，预计31日用完。县府已向当局再申请5000剂，但担心连当局也缺疫苗，农业处已签报动用预备金向药商购买。

不到一星期，基隆民间医院疫苗也全部注射一空，市府产业发展处农林行政科仅剩最后的400剂。基隆市兽医公会理事长张豪炯表示，预计8月底才有机会进货，未来整整1个月恐怕无疫苗可打，要赶紧想办法。

嘉义县家畜疾病防治所长翁有助指出，嘉县原有8000支疫苗，目前库存仅剩600剂，严重吃紧，日前紧急向中华民国行政院农业委员会申请配发1.2万剂，但目前尚无进一步消息。

台中市也有疫苗告急情形，现有疫苗约4200剂，但需求至少8万剂，当局计划9月初发放大量疫苗，缓不济急。

“今日疫苗已用完”的海报贴在台中市南屯区动物保护防疫处门口，让带着爱犬上门欲施打疫苗的民众很无奈。动物保护部门表示，将紧急采购2万剂。

连目前仍是“非疫区”的台北、新北，也传出有兽医院已没有疫苗可以打了。家住新北市的胡姓饲主29日早上赶紧带着宠物狗狗到兽医院打疫苗。他说，为了避免白跑，出门前打电话询问兽医院还有没有疫苗，但还是排了半小时才打到，后面还一直有人挤着排队等待。